La biblioteca si caratterizza per un ricco fondo di periodici specializzati in archeologia italiana, europea e americana: 330 testate per oltre 5587 fascicoli, per un totale complessivo di 10.000 volumi.

La collezione di periodici è il risultato dello scambio della Rivista Archeologia dell'Antica Provincia e Diocesi di Como (fondata nel 1872) con importati istituzioni scientifiche in tutto il mondo. Ciò ha permesso a questa biblioteca di creare una collezione di edizioni rare di riviste pubblicate dalla seconda metà dell'Ottocento.

Legato Ignazio Vigoni. Il nobile milanese Ignazio Vigoni ha lasciato alla Società Archeologica immagini e schede da lui raccolte e compilate che documentano la storia dell'architettura e dei particolari architettonici di edifici dei territori di Menaggio e Porlezza. Questo ricco materiale compone 30 faldoni.